PG - Met Diversidade
Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Evolução - Universidade Federal de Goiás
Métodos para Quantificar a Diversidade Biológica
09 a 13 de Novembro de 2009
Prof. Adriano Sanches Melo
Dep. Ecologia, ICB, Universidade Federal de Goiás - asm.adrimelo.jpg)
gmail.com
www.ecoevol.ufg.br/ladiv/
Ementa: Introdução ao uso do ambiente R. Introdução às técnicas mais comuns em estudos de diversidade. Gerenciamento de dados de diversidade em planilhas eletrônicas e bancos de dados. Índices de riqueza e de diversidade. Estimativas de riqueza de espécies. Modelos de abundância relativa. Diversidade alfa, beta e gama. Índices de Similaridade e Análises de Similaridade. Modelos espécie X área.
Programação
Segunda (09)
08:30-12:00hs Introdução MD-aula1.pdf
Objetivos de quantificar a diversidade: a) Teoria e b) Aplicações
Todos grupos são interessantes
Diversidade e estatística; Uso de métodos de diversidade em trabalhos
Uso de formulas no MS Excel
Introdução ao programa R e noções de programação
14:00-18:00hs Exercícios
Riqueza de espécies MD-aula2.pdf
Índices de riqueza
Curvas de acumulação de espécies
Taxas de encontro de espécies raras
Rarefação
Exercícios japi.txt Exercicios.xls
Terça (10)
08:30-12:00hs Não haverá aula.
14:00-18:00hs Extrapolação MD-aula3.pdf
Riqueza na comunidade
Riqueza numa amostra maior
Índices de diversidade
Índices de equabilidade
Série de Hill
Quarta (11)
08:00-09:30hs Modelos de abundância relativa MD-aula4.pdf
Componentes espaciais da diversidade
14:00-18:00hs Exercícios lago-trop.txt lago-temp.txt
Quinta (12)
08:30-12:00hs
Índices de similaridade e ANOSIM MD-aula5.pdf
14:00-17:00hs Exercícios lagos.txt
Sexta (13)
08:30-12:00hs Não haverá aula
14:00-17:00hs Prova (exercícios de avaliação se a palavra 'prova' for muito forte para você...)
Bibliografia sugerida
Segunda
Venables, W.N., D.M. Smith e The R Development Core Team. 2003. An introduction to R. Notes on R: A Programming Environment for Data Analysis and Graphics. Arquivo no formato pdf dentro do programa R, disponível em www.r-project.org
Monteiro, L.R. e J.L. Gomes Jr (colaborador). 2006. Introdução à biometria utilizando R. Laboratório de Ciências Ambientais, UNiversidade Estadual do Norte Fluminense, disponível em http://www.r-project.org/ PDF.
Gotelli, N.J. e R.K. Colwell. 2001. Quantifying biodiversity: procedures and pitfalls in the measurement and comparison of species richness. Ecology Letters 4: 379-391. PDF
Magurran, A.E. 2004. Measuring biological diversity. Blackwell Pub.,Oxford (Cap. 5).
Melo, A.S. O que ganhamos ‘confundindo’ riqueza de espécies e equabilidade em um índice de diversidade?
Biota Neotrop., 8(3): http://www.biotaneotropica.org.br/v8n3/pt/fullpaper?bn00108032008+pt
Terça
Estimadores de riqueza
Colwell, R.K. e J.A. Coddington. 1994. Estimating terrestrial biodiversity through extrapolation. Philosophical Transactions of the Royal Society series B 345:101-118.. PDF
Melo, A.S., R.A.S. Pereira, A.J. Santos, G.J. Shepherd, G. Machado, H.F. Medeiros e R.J. Sawaya. 2003. Comparing species richness among assemblages using sample units: why not use extrapolation methods to standardize different sample sizes? Oikos 101: 398-410. PDF
Melo A.S. 2004. A critique of the use of jackknife and related non-parametric techniques to estimate species richness. Community Ecology 5: 149-157. PDF
Índices de diversidade
Magurran, A.E. 2004. Measuring biological diversity. Blackwell Pub.,Oxford (Cap. 4).
Índices de equitabilidade
Beisel, J-N., P. Usseglio-Polatera, V. Bachmann e J.C. Moreteau. 2002. A comparative analysis of evenness index sensitivity. International Review of Hydrobiology 88: 3-15. PDF
Série de Hill
Tóthméréz. B. 1995. Comparison of different methods for diversity ordering. Journal of Vegetation Science. 6: 283-90.
Magurran, A.E. 2004. Measuring biological diversity. Blackwell Pub.,Oxford (Cap. 5, pp 148-149).
Mendes, R.S, L.R. Evangelista, S.M. Thomaz, A.A. Agostinho e L.C. Gomes. 2008. A unified index to measure ecological diversity and species rarity. Ecography 31: 450-456. PDF
Quarta
Modelos de Abundância Relativa
Magurran, A.E. 2004. Measuring biological diversity. Blackwell Pub.,Oxford (Cap. 2).
Diversidade Beta
Gering, J.C. e T.O. Crist. 2002. The alpha-beta-regional relationship: providing new insights into local-regional patterns of species richness and scale dependence of diversity components. Ecology Letters 5: 433-444. PDF
Magurran, A.E. 2004. Measuring biological diversity. Blackwell Pub.,Oxford (Cap. 6).
Veech, J.A., K.S. Summerville, T.O. Christ e J.C. Gering. 2002. The additive partitioning of species diversity: recent revival of an old idea. Oikos 99: 3-9. PDF
Quinta
Warton, D.I. e H.M. Hudson. 2004. A Manova statistic is just as powerful as distance-based statistics, for multivariate abundances. Ecology: 85: 858-874. PDF
Wolda, H. 1981. Similarity indices, sample size and diversity. Oecologia 50: 296-302.